Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms