Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTTNQ14247 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms