Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms