Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPEQ02224 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPEQ02224 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms