Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms