Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms