Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms