Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMA1P25391 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LAMA1P25391 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LAMA1P25391 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAMA1P25391 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms