Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XBP1P17861 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XBP1P17861 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XBP1P17861 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms