Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBTFP17480 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBTFP17480 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBTFP17480 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBTFP17480 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBTFP17480 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBTFP17480 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBTFP17480 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
UBTFP17480 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBTFP17480 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBTFP17480 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBTFP17480 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms