Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPLO60437 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPLO60437 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPLO60437 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPLO60437 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPLO60437 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPLO60437 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PPLO60437 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPLO60437 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PPLO60437 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PPLO60437 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPLO60437 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPLO60437 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPLO60437 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPLO60437 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms