Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms