Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms