Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD5Q99717 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD5Q99717 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5Q99717 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5Q99717 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5Q99717 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5Q99717 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5Q99717 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5Q99717 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5Q99717 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5Q99717 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5Q99717 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5Q99717 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5Q99717 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5Q99717 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms