Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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