Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms