Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTCQ00610 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms