Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP12P39900 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP12P39900 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP12P39900 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP12P39900 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MMP12P39900 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MMP12P39900 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MMP12P39900 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MMP12P39900 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MMP12P39900 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms