Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms