Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms