Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOP08100 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms