Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSLP07711 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSLP07711 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSLP07711 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSLP07711 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSLP07711 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSLP07711 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSLP07711 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSLP07711 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSLP07711 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSLP07711 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSLP07711 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSLP07711 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSLP07711 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms