Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYBBP04839 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms