Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms