Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB3O43889 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB3O43889 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB3O43889 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB3O43889 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB3O43889 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB3O43889 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB3O43889 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms