Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms