Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms