Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCOLN1Q9GZU1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCOLN1Q9GZU1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MCOLN1Q9GZU1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms