Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDGFDQ9GZP0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDGFDQ9GZP0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDGFDQ9GZP0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PDGFDQ9GZP0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDGFDQ9GZP0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDGFDQ9GZP0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PDGFDQ9GZP0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDGFDQ9GZP0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDGFDQ9GZP0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDGFDQ9GZP0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDGFDQ9GZP0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDGFDQ9GZP0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDGFDQ9GZP0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PDGFDQ9GZP0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms