Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT8L2Q96SF2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L2Q96SF2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms