Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPZA3Q96KX2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms