Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LLGL2Q6P1M3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LLGL2Q6P1M3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms