Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc5a6Q5U4D8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a6Q5U4D8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms