Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL22Q53GT1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL22Q53GT1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms