Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2BFSP57053 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2BFSP57053 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms