Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH1P12830 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH1P12830 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH1P12830 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH1P12830 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH1P12830 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH1P12830 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH1P12830 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH1P12830 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH1P12830 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH1P12830 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH1P12830 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH1P12830 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH1P12830 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH1P12830 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH1P12830 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH1P12830 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH1P12830 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH1P12830 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH1P12830 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH1P12830 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH1P12830 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH1P12830 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH1P12830 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH1P12830 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH1P12830 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH1P12830 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH1P12830 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH1P12830 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH1P12830 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH1P12830 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH1P12830 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH1P12830 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH1P12830 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH1P12830 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH1P12830 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH1P12830 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH1P12830 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH1P12830 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH1P12830 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH1P12830 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH1P12830 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH1P12830 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH1P12830 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH1P12830 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH1P12830 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH1P12830 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH1P12830 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH1P12830 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH1P12830 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH1P12830 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH1P12830 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH1P12830 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH1P12830 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH1P12830 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH1P12830 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH1P12830 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH1P12830 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH1P12830 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH1P12830 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH1P12830 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH1P12830 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH1P12830 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH1P12830 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH1P12830 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH1P12830 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH1P12830 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH1P12830 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH1P12830 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH1P12830 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH1P12830 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH1P12830 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH1P12830 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH1P12830 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH1P12830 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH1P12830 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH1P12830 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH1P12830 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH1P12830 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH1P12830 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH1P12830 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms