Protein–RNA interactions for Protein: O60902

SHOX2, Short stature homeobox protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOX2O60902 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOX2O60902 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHOX2O60902 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOX2O60902 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms