Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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H2-Q1O19441 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Q1O19441 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Q1O19441 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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H2-Q1O19441 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Q1O19441 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Q1O19441 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Q1O19441 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Q1O19441 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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H2-Q1O19441 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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H2-Q1O19441 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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H2-Q1O19441 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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H2-Q1O19441 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Q1O19441 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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H2-Q1O19441 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Q1O19441 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Q1O19441 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Q1O19441 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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H2-Q1O19441 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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