Protein–RNA interactions for Protein: L7N253

4930555G01Rik, RIKEN cDNA 4930555G01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930555G01RikL7N253 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930555G01RikL7N253 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930555G01RikL7N253 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms