Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm340F6RGI3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gm340F6RGI3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms