Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM23A6NLE4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM23A6NLE4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM23A6NLE4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM23A6NLE4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMIM23A6NLE4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM23A6NLE4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms