Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSDA5PKW4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSDA5PKW4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PSDA5PKW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms