Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRPF3Q9ULD4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms