Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms