Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms