Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms