Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRTQ9BXP5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms