Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms