Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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USP43Q70EL4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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USP43Q70EL4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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USP43Q70EL4 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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USP43Q70EL4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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USP43Q70EL4 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USP43Q70EL4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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