Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms